作為微生態制劑菌種的選擇應該符合一定的條件：

1.微生態制劑的菌種必須是有益菌,安全性好,無致病性。絕大多數益生菌種分離于健康的動物腸道內,容易形成共生體系,對宿主無致病性。

2.微生態制劑的菌種可以產生有利于宿主健康的活性物質。這類物質包括蛋白酶、淀粉酶、纖維素酶等酶類物質,氨基酸、維生素等營養物質和一些膚類、脂膚類等抗病原菌的物質。

3.微生態制劑的菌種可以定植在腸道表面,還需有一定的抗逆性,在胃腸道中的高酸、高鹽的環境下都可以存活比較長的時間。